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https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/handle/123456789/1735
Título : | Identificação de microrganismos aquáticos das regiões de várzea do Arapixuna e do Pixuna do Tapará, através de sequenciamento de nova geração |
metadata.dc.creator: | FARIAS, Raquel Silva de |
Palabras clave : | DNA ambiental;Metabarcoding;Diversidade |
Fecha de publicación : | 19-ene-2023 |
Editorial : | Universidade Federal do Oeste do Pará |
Citación : | FARIAS, Raquel Silva de. Identificação de microrganismos aquáticos das regiões de várzea do Arapixuna e do Pixuna do Tapará, através de sequenciamento de nova geração. Orientador: Gabriel Iketani Coelho. Coorientadora: Luciana Pimentel. 2023. 30 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Ciências Biológicas) – Universidade Federal do Oeste do Pará, Santarém, 2023. Disponível em: https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/handle/123456789/1735 |
Resumen : | A new approach called metabarcoding for environmental DNA that aims to identify the diversity of taxa and the composition of biodiversity, using universal primers, has been highlighted for its efficiency. Our objective was to identify and compare the aquatic microorganisms in two varzea regions (Pixuna do Tapará and Arapixuna), on the banks of the Amazon River, in the municipality of Santarém-PA, and in different extracts of the water column. The samples were filtered and from the filters the eDNA was extracted, the 16S rRNA gene was amplified through PCR, these products were purified and used for the construction of libraries that were later sequenced using the Next Generation Sequencing technique. Data analyses were performed in R 4.5.0 software. The results showed that there was no statistical difference in biological diversity indices (Richness, Diversity/Shannon and Equitability/Pielou's) among the analyzed regions, when evaluated at the DNA level. The genera identified with abundance greater than 5% were Polynucleobacter, na (which are unidentified genera, or not listed in the reference databases), Hgcl clade and the marine group CL500-29. The families that presented relative abundance values higher than 1% were: Comamonadaceae, Burkholderiaceae, Ilumatobacteraceae, Methylophilaceae, Pedosphaeraceae, and Sporichthyaceae. These families correspond to about 99% of the sequences analyzed. Thus, the eDNA study proved to be efficient for the evaluation of microorganisms present in these várzea areas and, the metabarcoding approach shows promise to assist large-scale biological surveys. |
metadata.dc.description.resumo: | Uma nova abordagem chamada de metabarcoding para DNA ambiental, que tem como finalidade identificar a diversidade de táxons e a composição da biodiversidade, a partir de primers universais, tem se destacado por sua eficiência. O objetivo deste estudo foi identificar e comparar os microrganismos aquáticos em área de várzea (Pixuna do Tapará e Arapixuna), às margens do rio Amazonas, no município de Santarém-PA e, em diferentes extratos da coluna d’água. As amostras foram filtradas, a partir dos filtros realizou-se a extração de eDNA e o gene RNAr 16S foi amplificado através de PCR. Os produtos foram purificados e utilizados para a construção de bibliotecas que, posteriormente, foram submetidos à técnica de Sequenciamento de Nova Geração. As análises dos dados foram realizadas no software R 4.5.0. Os resultados demonstraram que não houve diferença estatística entres os índices de diversidade biológica (Riqueza, Diversidade/Shannon e Equitabilidade/Pielou’s) entre as regiões analisadas, quando avaliadas a nível de DNA. Os gêneros identificados com abundância maior que 5% foram Polynucleobacter, na (que são gêneros não identificados, ou que não constam nos bancos de dados de referência), Hgcl clade e o grupo marinho CL500-29. As famílias que apresentaram valores de abundância relativa maior que 1%, foram: Comamonadaceae, Burkholderiaceae, Ilumatobacteraceae, Methylophilaceae, Pedosphaeraceae e Sporichthyaceae. Estas famílias correspondem a cerca de 99% das sequências analisadas. Desta forma, o estudo do eDNA mostrou-se eficiente para a avaliação dos microrganismos presentes nestas áreas de várzea e, a abordagem de metabarcoding mostra-se promissora para auxiliar levantamentos biológicos de grande escala. |
URI : | https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/handle/123456789/1735 |
Aparece en las colecciones: | ICTA - TCC - Bacharelado em Ciências Biológicas |
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