Diversidade cromossômica e molecular (DNA BARCODE) no complexo Hoplias malabaricus (CHARACIFORMES, ERYTHRINIDAE) da região do Baixo Amazonas
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Universidade Federal do Oeste do Pará
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Hoplias malabaricus, popularly known as trahira is classified inErythrinidae, Order
Characiformes. Cytogenetic studies showed highchromosomal variation among
populations,have been classified into seven cytotypes (A-G). Molecular data
evidencedhigh levels of genetic diversity and support the hypothesis of
H.malabaricusasa species complex, including independent biological units. Genetic
studies in populations of trahiras in the Amazon Basin are scarce and the studies
developed so farrarely resolved this species complex.This work describes the
molecular and chromosomal diversity in the complex H. malabaricusfrom Amazon
basin.Were collected 59 specimens fromeight localities in the lower Amazon River,
state of Pará, Brazil.For chromosomal analysis, it was processed conventional
staining, C-banding, Ag-NOR staining, CMA3 staining and FISH with 18S rDNA
probes. For molecular analysis the genetic distances were accessed from DNA
barcodes sequences (gene cox I) using Neighbor-joining with K2P model, and
median joining for haplotype network.Thestudy showed the presence of distinct
karyotypes with diploid numbers of 40, 41 and 42, that were classified in four
cytotypes: A, C, E and G; NORsshowed different number and locations between
cytotypes andcollection points. The C-banding pattern was homogeneouswithin each
cytotype.DNA Barcode analysis clearly revealed two groups, which canindicate the
presence of an undescribed Hoplias in the lower Amazon region.This is the firstwork
in the lower amazon that aim to discriminate species of the Hoplias
malabaricuscomplex, correlating data with cytogenetic markers andcontributing to the
molecular validation of the efficacy of DNA Barcode.
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Hoplias malabaricus, popularmente conhecida como traíra é classificada em
Erythrinidae, Ordem Characiformes. Estudos citogenéticos demonstraram grande
variação cromossômica entre populações, sendo classificadas em sete citótipos(AG).
Dados moleculares evidenciam altos índices de divergência genética e apóiam a
hipótese que o táxon nominal Hoplias malabaricus seja um complexo de espécies,
formado por unidades biológicas independentes. Os estudos genéticos em
populações de traíra na Bacia Amazônica são escassos e todos os trabalhos
desenvolvidos até hoje nesse táxon não evidenciam de forma precisa relações
moleculares e cromossômicas capazes de discriminar o número real de espécies
dentro desse complexo. O presente trabalho visou caracterizar a diversidade
cromossômica e molecular utilizando a metodologia do DNA BARCODE no
complexo H. malabaricus (Characiformes, Erythrinidae) da região do baixo
amazonas. Para isso foram coletados 59espécimes de H. malabaricus de oito
localidades da região do baixo amazonas no Estado do Pará. Foram realizadas 53
preparações cromossômicas, análise convencional para descrição do citótipo
correspondente, técnicas de bandeamento C, detecção de NOR por marcação com
AgNO3 e hibridização por fluorescência (FISH) com sonda rDNA 18S, bem como
marcação das regiões ricas em GC por cromomicina (CMA3); para análise molecular
foram sequenciadas 54 amostras do gene citocromo oxidase subunidade I (Cox I)
sendo que as distâncias genéticas foram estimadas adotando-se os métodos de
agrupamento de vizinhos com o modelo K2P, usando-se o programa MEGA e
ferramentas online do BOLD.As relações genéticas entre haplótipos foram
evidenciadas com o método Median-Joining usando-se o programa NETWORK. O
estudo evidenciou a presença de quatro citótipos: A, C, E e G; padrões de NOR
evidenciam diferentes marcações tanto entre citótipos quanto entre pontos de coleta
sendo o padrão de bandeamento C homogêneo por citótipo. A rede de haplótipos
mostra que há fluxo gênico entre as populações e os índices de divergência
elevados entre os citótipos A, E e G comparados com o citótipo C, entretanto, não foi
possível uma separação total por citótipos quando os quatro foram testados
conjuntamente. Por outro lado, a análise de DNA Barcode revelou claramente dois
grupos, que podem caracterizar a presença de espécie não descrita na população
de H. malabaricus do baixo Amazonas. Este se caracteriza como o primeiro trabalho
que visa a discriminação de espécies do complexo Hoplias malabaricus,
correlacionando dados com marcadores citogenéticos e moleculares contribuindo na
validação da eficácia do DNA Barcode.
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MARQUES, Diego Ferreira. Diversidade cromossômica e molecular (DNA BARCODE) no complexo Hoplias malabaricus (CHARACIFORMES, ERYTHRINIDAE) da região do Baixo Amazonas. Orientador: Luis Reginaldo Ribeiro Rodrigues. 2011. 72 f. Dissertação (Mestrado em Recursos Naturais da Amazônia) - Programa de Pós-graduação em Recursos Naturais da Amazônia, Universidade Federal do Oeste do Pará, Santarém, 2011. Disponível em: https://repositorio.ufopa.edu.br/handle/123456789/213. Acesso:.
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